重庆市农村饮水安全工程水质卫生监测结果表明，我市农村安全饮水工程的卫生质量差，水质卫生合格率低于10%。
2008年，我市组织疾病防控专家对全市31个区县（自治县）的842处集中式农村饮水安全工程的水质进行了监测。据介绍，每个监测点一年分枯水期和丰水期各监测1次，每次采集出厂水、末梢水水样各1份。监测内容主要为包括消毒情况、供水范围、覆盖人口以及水的硬度、色度、PH值、大肠菌群数、砷含量等在内的20多项指标。监测结果显示，在丰水期，这些工程的水质卫生指标合格率8．7%，在枯水期为8．9%。不合格指标主要为大肠菌群等微生物指标超标。
监测还发现，６３．４８％的农村安全饮水工程没有消毒设施，而有消毒设施的工程设施坚持使用率不到三成。只有２５％的工程完全按照沉淀、过滤、消毒的程序，对水进行了处理。
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