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微生物分类单元的命名



录入时间:2010-11-11 9:31:02 来源:百度百科

分类单元的命名

  生物名称分两类,一类是区域性的俗名(vernacular name);另一类是国际上统一使用的名称,即学名(scientific name)。

  俗名是一个国家或地区使用的普通名称,如我们把引起人结核病的细菌叫结核杆菌,而英语称“tubercle bacillus”,而俄语则称“tyбepkyлёзная палочка”。俗名的优点是在一定的区域内通俗易懂便于记忆,但俗名有局限性,尤其是不便于国际间的交流。所以为了使生物分类单元的名称能在国际上通用,就需要制定一个为各国生物学工作者共同遵守的命名法则,即国际生物命名法规,来管理生物分类单元的命名,以确保生物名称的统一性、科学性和实用性。现在分别由国际动物命名法规、国际植物命名法规和国际细菌命名法规来分别管理各类生物的命名。据报道,目前正在制定适用于各类生物的统一的国际生物命名法规,预计新的统一的生物命名法规到2000年正式实施,下面以细菌为例简要介绍有关微生物命名的基本常识。

  1.分类单元的命名 所有正式分类单元(包括亚种和亚种以上等级的分类单元)的学名,必须用拉丁词或其他词源经拉丁化的词名。属名 属名用一个单数主格名词或当作名词用的形容词来表示,可以是阳性、阴性或中性,首字母要大写。例如,Bacillus(芽孢杆菌属)(阳性),拉丁词,原意为小杆菌因该属菌有芽孢而译为?把挎吒耸艟保籆lostridium(梭菌属)(中性),源于希腊词,原意为纺锤状菌;Salmonella沙门氏菌属)(阴性),以美国细菌学家D.E.Salmon的姓氏命名。种名 和其他生物一样,细菌的种名也用双名法(binomial nomenclature)命名,即种的学名由属名和种名加词两部分组合而成。第一个次为属名,首字母要大写;第二个词为种名加词,常用形容词(要与属名性别一致),也可以用人名、地名、病名或其他名词(名词用主格或所属格形式),种名加词首字母不大写。例如,Pseudomonas aeruginosa(铜绿色假单胞菌),其中,Pseudomons是属名(假单胞菌属)(阴性);aeruginosa是种名加词,是拉丁语形容词(阴性),原意为铜绿色的;Mycobacterium tuberculosis(结核分枝杆菌),其中 Mycobacterium是属名(分枝杆菌属)系希腊词源的复合词(中性),tuberculosis是种名加词,是希腊词和拉丁词缀合成的名词所属格形式,意为结核病的;Bacillus thuringiensis(苏云金芽孢杆菌),其中 thuringiensis是种名加词,它是德国地名Thuringia的拉丁语所属格形式。当泛指某一属细菌而不特指该属中任何一个种(或未定种名)时,可在属名后加sp.spp.(某些微球菌)。亚种名亚种名为三元式组合,即由属名、种名加词和亚种名加词构成。例如: Alcaligenes denitrificans subsp. xylosoxydans 属名 种名加词 subspecies 亚种名加词 (产碱杆菌属)(反硝化的) 的缩写(亚种) (氧化木糖的) 该亚种名可译为:反硝化产碱杆菌氧化木糖亚种. ⑷ 属级以上分类单元的名称 亚科、科以上分类单元的名称,是用拉丁或其他词源拉丁化的阴性复数名词(或当作名词用的形容词)命名,首字母都要大写。其中细菌目、亚目、科、亚科、族和亚族等级的分类单元名称都有固定的词尾(后缀),其词尾的构成及例子见表12-4。 此外,在分类单元名称的后面还可以附上命名人的姓名和命名年号。例如Staphylococcus aureus Rosenbach 1884,这表明该菌(金黄色葡萄球菌)是由Rosenbach 1884年命名的。属、种和亚种等级的分类单元的学名在正式出版物中应用斜体字印刷,以便识别。

   2. 命名模式及其指定 如前所述,由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准,为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱,细菌系统分类也像其他生物分类一样采用模式概念。即根据命名法规要求,正式命名的分类单元应指定一个命名模式(简称模式)作为该分类单元命名的依据。种和亚种指定模式菌株(type strain);亚属和属指定模式种(type species);属以上至目级分类单元指定模式属(type genus)。因此,当某一菌株被鉴定为一个新种或新的亚种时,该菌株就应指定为该种或该亚种的模式菌株;如果有几个菌株同时被鉴定为一个新种或亚种,则必须指定一个较有代表性的菌株作为该种或亚种的模式菌株。模式菌株应送交菌种保藏机构保藏,以便备查考和索取。模式种和模式属的确定也大体如此。

  3. 新名称的发表 根据细菌命名法规的规定,有效发表新的细菌名称应在公开发行的刊物上进行,在菌种目录、会议记录、会议论文摘要的均不能视为有效发表。此外,若新名称是在国际系统细菌学杂志(IJSB)以外的其他杂志上发表的,要取得国际上承认和学名优先权,还必须经过新名称的合格化发表,即将有效发表的英文附本送交IJSB审查,被认为合格后,在该杂志上定期公布,命名日期即从公布之日算起,否则不算合格发表,也不能取得国际上的承认。发表新名称时,应在新名称之后加上所属新分类等级的缩写词,如新目“ord.nov.”、新属“gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。例如,Pyrococcus furiosesus sp.nov.表明该菌(猛烈火球菌)是一个新发表的种。

 

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