根据目前微生物分类学中使用的技术和方法，可把它们分成四个不同的水平：①细胞形态和行为水平；②细胞组分水平；③蛋白质水平；④基因组水平。 
    在微生物分类学发展的早期，主要的分类鉴定指标是以细胞形态和习性为主，可称为经典的分类鉴定法。其他三种实验技术主要是20世纪60年代以后采用的，称为化学分类和遗传学分类法，这些方法再加上数值分类鉴定法，可称为现代的分类鉴定方法。 
    经典分类法是一百多年来进行微生物分类的传统方法。其特点是人为地选择几种形态生理生化特征进行分类，并在分类中将表型特征分为主、次。一般在科以上分类单位以形态特征、科以下分类单位以形态结合生理生化特征加以区分。最后，采用双歧法整理实验结果，排列一个个的分类单元，形成双歧检索表。 
A、 能在60°以上生长 
     B、细胞大，宽度1.3—1.8um…………………………………………1、热微菌属 
     B.B细胞小，宽度0.4—0.8um 
       C.能以葡萄糖为碳源生长 
         D.能在pH4.5生长………………………………………………2、热酸菌属
       DD.不能在pH4.5生长……………………………………………3、栖热菌属
    CC、不能以葡萄糖为惟一碳源生长………4、栖热嗜油菌属（栖热嗜狮菌） 
 AA 、不能在60°以上生长 
    应用BIOLOG-GN仪检测分离菌株对众多碳源的利用情况判断分离菌株的分类地位，近年来也时有应用。在BIOLOG-GN仪上有96个小孔，其中95孔内分装有95种不同碳源的缓冲液，1孔为无碳源的缓冲液对照，各孔接入适宜菌浓度和液量的分离菌株培养物，定温培养，每日定时读取BIOLOG-GN仪计算机上各碳源利用情况，一般为时1周，BIOLOG-GN仪可显示出该鉴定菌株的最可能归属。

 

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